建立工件坐标系是数控加工的重要内容之一。数控车床建立工件坐标系实际就是将用户选定的编程坐标系告知CNC系统，若不能正确建立工件坐标系，即使编程指令正确，机床仍可能产生误动作。摇臂钻床机床的误动作有可能损坏数控刀具、机床，甚至可能会伤害到用户。
由于数控加工中心系统功能不同，建立工件坐标系的具体方法有所不同。但基本原理相类似。
a.直接法。直接法即试切法。启动主轴，选定一把基准刀接触工件上表面，设置Zo，即将基准刀Z向补偿值设为“o”;其他刀也触碰同一表面，标定其他刀的Z向补偿值。用数控刀具接触工件侧面设置X。、Yo。测量数控刀具直径或根据数控刀具公称直径确定数控刀具半径补偿值。
b.间接法。数控刀具不旋转，选择一把基准刀接触量块或Z向设定器，设置Z。。将基准刀Z向补偿值设为“0”，其他刀触碰同一表面，标定Z向补偿值。Xo、y。及数控刀具半径补偿值的确定相同。
c.机内对刀。机内对刀通常使用机床自备的机内对刀仪。